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判断AKI我们可以通过肌酐和尿量两个指标来看, 今天我们主要提取肌酐。
kidgo指南的表格
AKI是MIMIC相关研究的常用指标,MIMIC数据库里面AKI诊断按照KIDGO指南,内容太多,今天这个只包括肌酐水平评估:
MIMIC数据库里面的基线值并不是一个固定的值而是动态的值。
主要涉及ICU住院记录icustays和实验室检查labevents两张表。
labevents表里CHARTTIME表示测量时间,VALUENUM表示测量值。
icustays表里面intime和outtime分别表示出入ICU时间。
两张表格根据subject_id这个患者唯一标识进行连接。
一、kdigo_creatinine.sql 提取入ICU前7天所有肌酐值
二、kdigo_stages.sql 基线标准
如何理解上面说的这个基线值是动态的?我们来看下kdigo标准的sql
我们来从organfailure_kdigo_stage_cr_only里面选取一个病人来看。
sCR >=4.0
sCR 增量 >=0.3 48h内 or sCR 基线* 1.5
然而,上述代码的逻辑是由固定数字3.7定义的。这是错误的定义,所以应该改为
查看筛选出来的数据是有很大差异的
该问题官方已经准备在下个版本修复
这是有道理的,对于初始肌酐为 4.0 或更高的人来说,这不会导致 AKI。我会尽快修复它,可能值得进行前后比较。