超算技术投入新型冠状病毒基因组分析
中国新闻网2020-03-03 13:02
(抗击新型肺炎)超算技术投入新型冠状病毒基因组分析
中新网北京3月3日电 (记者 刘育英)英特尔、联想以及华大基因3日宣布，三家公司正携手加快COVID-19新型冠状病毒的基因组特性分析。
在基因测序工作中，每毫升体液通常会包含数百万个不同的病毒体，而每个病毒体的基因组则包含大约30,000个DNA碱基或字母。华大基因正在对许多感染患者和疑似感染患者的微生物进行基因测序，因此这些研究工作将会生成TB级乃至PB级的海量数据。
要想高效地快速处理这些重要数据，就需要采用更为先进的高性能计算基础架构、计算技术以及优化的基因组分析方法。
英特尔和联想携手为华大基因提供的技术包括一个大型高性能计算集群，可用于处理从华大DNBSEQ-T7测序系统读取的高通量数据。华大基因的研究人员将能够通过全新的高性能计算和基因组分析技术，以及英特尔和联想的相关资源和专业知识，进一步加速他们对新型冠状病毒的基因组特性研究。
该技术将支持科学家研究病毒的毒性、传播模式、病原体与宿主间的相互作用，进而助力流行病学及疫苗设计研究。这些工作对于未来创建更好的诊断方法和设计有效的疫苗或其他保护性措施(例如免疫疗法)是非常必要的。
通过这项合作，华大基因将得以继续优化其新型冠状病毒检测试剂盒并获取大量有价值的信息。(完)
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