近年来，连花清瘟作为一种传统中药复方制剂，在防治呼吸系统疾病方面展现出了其独到的优势。从组方配伍角度来看，全方将清热、解毒、辛温、通腑、芳化、扶正的药物相结合，相互协同。具体分析其配伍特点有以下几点：

1、清热与辛温兼备：连花清瘟组方中连翘、金银花、薄荷脑、石膏辛凉解表、清热泄肺；同时配伍辛温药物麻黄辛温解表，苦杏仁宣肺止咳，具有清而不过凉，温而不助火的特点。

2、解毒与芳化并用：绵马贯众、板蓝根、鱼腥草、甘草能清肺解毒，抗毒抑菌，又配伍广藿香芳香化湿，辟秽和胃。

3、扶正与通腑同施：方中红景天能补气清肺、调节免疫、耐受缺氧。现代研究证实其具有抗病毒、抗炎、调节免疫、耐缺氧、保护肺微血管内皮细胞等功能。配伍大黄，借其泻下荡涤肠胃积滞，另寓有通腑清肺、通腑泄肺、通腑安肺之义，腑气下通而肺气自降、肺热自清，从而扭转病机，截断病势，切断向营血的传变。扶正与通腑相配，扶正不留邪，祛邪不伤正。

同时，连花清瘟对于病毒类呼吸系统传染病治疗的有效性，也得到了现代医学研究的验证。基础研究显示，连花清瘟对引起普通感冒的副流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒、单纯疱疹病毒等多种病毒，以及甲型流感病毒（H1N1、H3N2等）、乙型流感病毒等多种流感病毒均具有抑制作用。