菲律宾海警队6月7日下午发布视频显示，6月4日至5日，他们的船只在仙宾礁潟湖内停留了50天。在此期间，“马格巴努亚”号巡逻船突然部署了数艘小舟，载着所谓的“海洋科学专家”和新闻记者，试图接近仙宾礁的珊瑚浅滩并进行潜水等非法行为。

此一发现后，中国海警的3303号舰和4103号舰正在仙宾礁执行跟踪警戒任务，迅速派遣执法快艇对菲律宾小舟实施拦截。在双方快艇交锋中，菲律宾快艇至少三次故意驶向我方快艇并发生碰撞。我方海警队员表现镇定，多次向菲方发出停止的警告。

中国海警的此次拦截操作得到了海军的强力支持。海军的直-8型直升机从“五指山”号两栖登陆舰上起飞，对菲方非法行为进行空中拍摄证据。同时，海军的071型两栖登陆舰“五指山”号部署了两艘“野马”气垫船进行威慑性抢滩训练，另有072A型坦克登陆舰“云雾山”号在附近进行配合。

考虑到现场情况可能的变动，中国的21555号和21556号快艇于6月5日抵达仙宾礁进行增援。截至6月8日，中国在仙宾礁海域的军事力量包括4艘海警船（3303、4103、21555、21556号）、两艘登陆舰（987号和997号）以及一艘海洋调查船。菲律宾方面主要由两艘海警船和“马格巴努亚”号巡逻舰组成。中方船只在数量和战斗力上均占有绝对优势，特别是071型两栖登陆舰的存在，其战斗力远超菲方。

071型舰的排水量达到2.5万吨，可以搭载4艘726型“野马”气垫登陆舰，运输近50辆各种装甲车辆，并可携带4架直-8型直升机，运送一个完整的800人规模的陆战营。这种舰艇具有垂直登陆的作战能力，一架直-8直升机可运送27名陆战队员进行垂直登陆，一艘726型气垫船能够载运一辆两栖突击车和两辆步兵战车，以及80名陆战队员，随时准备执行超平面的登陆作战。