儿童门诊自费后医保报销的流程如下：

1. 首先，监护人需要携带孩子的医保卡、身份证、户口本等相关证件，以及门诊发票、诊断证明、药品清单等相关材料。

2. 前往您所在地区的医保局或社保中心办理报销手续。请注意，不同地区的报销政策和流程可能有所不同，建议您提前了解当地的具体规定。

3. 在医保局或社保中心，您需要填写报销申请表，并提交相关材料。工作人员会对您的材料进行审核，确认符合报销条件后，会为您办理报销手续。

4. 报销款项通常会直接打入您的银行账户。您可以在医保局或社保中心的指定窗口查询报销进度和结果。

需要注意的是，不同地区的医保政策和报销比例可能有所不同，具体报销金额以当地医保部门的规定为准。此外，部分特殊药品、检查项目等可能不在医保报销范围内，可以在国家医保服务平台APP查询医保目录，看下哪些符合报销，哪些不符合。