根的次生结构是维管形成层和木栓形成层细胞分裂、分化所形成的根的次生木质部、次生韧皮部、木栓和栓内层等结构。

根分为三部分为顶端结构、初生结构和次生结构，顶端分生组织，是维管植物根和茎顶端的分生组织。植物体其他各种组织和器官发生，均由它的细胞增生和分化而来。其原始细胞较小，一般等径，排列紧密。细胞壁薄，液泡化程度较低，细胞质内细胞器丰富，顶端分生组织的细胞合成代谢旺盛，处于胚性状态。

初生结构植物的胚、茎端或根端的顶端分生组织细胞经过分裂、分化和生长形成的结构，初生结构是低等维管植物和草本种子植物的主要组成部分，担负着吸收、光合、蒸腾和生殖等重要功能，植物体在形成初生结构过程中，根、茎、叶、花、果实和种子等器官的生长和增大，称为初生生长，根尖的成熟区已分化形成各种成熟组织，这些成熟组织是由顶端分生组织经过细胞分裂、生长和分化形成的，把这种生长过程称为根的初生生长。

次生结构由根和茎的维管形成层和木栓形成层产生的结构。次生结构可增强植物体的支持、输导和贮藏等功能，维管形成层的不断活动，次生维管组织逐渐增多，从而使根和茎原来的外围初生组织，如表皮、皮层受到挤压，在根中一般由中柱鞘、在茎中由表皮或皮层的细胞转化为木栓形成层。木栓形成层向外产生木栓层，向内产生栓内层，共同组成周皮。