怒江草果全基因组精细图谱绘制成功

发布时间:01-1323:00

1月13日,经过1年多的努力,怒江傈僳族自治州联合华南农业大学等国内外高校科研院所机构,成功完成了草果全基因组测序工作,并绘制出精细图谱。

从20世纪70年代开始,怒江州就开始种植草果。脱贫攻坚中,怒江将草果为代表的绿色香料产业作为贫困群众增收脱贫的主打产业来抓。2020年,怒江成为全国草果的核心产区,面积已达111万亩,16.5万贫困群众从中受益。小小草果,成为怒江峡谷、独龙江峡谷两岸农民群众增收致富的“金果果”。

为了加快提高草果遗传改良效率,培育高产、抗病、优质、安全新品种,对从源头创新保障草果产业健康可持续发展。2019年9月,怒江州联合华南农业大学等国内外高校科研院所机构,启动草果全基因组测序计划,历时1年零3个月,成功完成草果全基因组测序工作,绘制了精细图谱,并于1月13日正式对外发布。

通过Nanopore及illumina等测序技术,拼接组装得到2.08G大小的基因组,组装出由1145个contig序列组成的草果参考基因组序列,GC含量为40.9%,最长的contig长度为31.6Mb,N50为4.7Mb。结合HiC测序结果,得到24对染色体的高质量基因组,包括42394个基因。通过转录组、代谢组关联分析,得到草果关键香气物质合成的候选基因一批。草果全基因组精细图谱完成将极大推动草果的全基因组精准育种,为从源头创新保障草果产业健康可持续发展,建立完善草果质量的标准体系,提高怒江草果在市场的认可度、知名度和核心竞争力提供重要基础作用 。

“十四五”时期,怒江将聚力发展以草果为核心的绿色香料产业,打造集“科研+种植+加工+销售+展示+旅游+康养”的草果全产业链融合发展新模式,做大绿色香料产业园、做实绿色香料产业研究院,建成国家草果科研试验基地,争创国家草果种质资源圃,加强草果质量标准体系建设,努力把“怒江草果”培育成“中国最优,世界一流”的知名品牌,让更多农民群众依靠草果产业过上更好的日子。

云南网记者 李寿华

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